Ülkemizde ilk tütün eksperliği eğitimi 1889 yılında Reji İdaresi tarafından verilmeye başlanmıştır. Reji İdaresi, yetiştirdiği tütün eksperlerini ilk kez uzman olarak çalıştırmıştır. Türkiye Cumhuriyeti döneminde reji uygulamasının kaldırılması/rejinin millileştirilmesinden sonra, 1929 yılında, TEKEL idaresi tarafından lise mezunlarına iki yıllık eğitim verilerek "tütün eksperi" yetiştirilmiştir. 1969 yılında yürürlüğe giren ''1177 sayılı Tütün ve Tütün Tekeli Yasası'' ile tütün eksperliği görevleri, Tütün Eksperleri Yüksekokulu mezunlarına verilmiştir. Bu yasa gereği, Gümrük ve Tekel Bakanlığı'nca 1975 yılında İstanbul'da kurulan Tütün Eksperleri Yüksekokulu (TEYO), lise mezunlarını ön kayıtla öğrenci alarak öğretime başlamıştır. 

Eğitim-Öğretim süresi 1978 yılında üç yıla, 1982 yılında dört yıla çıkmış ve 1983 yılında da 2809 sayılı yasa ile yüksekokul, İstanbul Üniversitesi Orman Fakültesi'ne bağlanmıştır. 1987 yılından itibaren TEYO mezunlarına "Tütün Endüstri Mühendisi" unvanı verilmeye başlanmış ve bu unvan daha sonra Yükseköğretim Kurulu'nun 01.03.1991 Tarih ve 91.9.257 Sayılı Kararı ile "Tütün Teknolojisi Mühendisi” olarak değiştirilmiştir.

1987 yılında 3389 sayılı yasa ile İstanbul'dan Akhisar'a nakli kararlaştırılan ve Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi'ne bağlanan yüksekokul, 1992 yılında yürürlüğe giren 3837 sayılı yasa ile kurulan Manisa Celal Bayar Üniversitesi'ne bağlanmış ve adı "Tütün Eksperliği Yüksekokulu" olarak değiştirilmiştir.

Tütün endüstrisinin ihtiyaç duyduğu tütün teknoloji mühendislerini yetiştiren Tütün Eksperliği Yüksekokulu, 1993 yılından itibaren Manisa-Akhisar'daki yerleşkesinde eğitim-öğretime başlamıştır. Halen, aynı yerde eğitim-öğretim faaliyetlerini sürdürmektedir. 2011-2012 Eğitim-Öğretim yılından itibaren de, Manisa'da Yabancı Diller Yüksekokulu bünyesinde "İsteğe Bağlı Hazırlık Sınıfı" uygulaması başlatılmıştır.

Tütün Eksperliği Yüksekokulu Akhisar Yerleşkesi iki katlı idari bina, derslikler, araştırma ve öğrenci uygulama laboratuvarları, bilgisayar laboratuvarları, 320 kişi kapasiteli konferans salonu, kütüphane, açık spor alanı, yemekhane ve kantinden oluşmaktadır.